Dobytí Oaxaca bylo relativně mírové, protože páni Zapotec a Mixtec si mysleli, že v Evropanech najdou spojence, které potřebují k porážce Aztéků.
Na druhou stranu další skupiny, jako například Zapotekové ze Sierry, Chontales a zejména Mixové, vzdorovali a provedli pokračování vzpour. Po svém triumfu, ještě v 16. století, Španělé svlékli domorodce ze svých zemí a legalizovali tuto akci prostřednictvím encomiendas, mercedesů a divizí udělených králem, a tak od počátku španělského dobytí načrtli nerovnováhu a nerovnost, která by panovala mezi španělskou a domorodou společností.
Zneužití kolonizátory bylo tak hojné, že velká část práce provedené dvěma Audiencias a místokrálem Antonio de Mendoza byla zaměřena na omezení moci markýze z Valle de Oaxaca, Hernána Cortése a moci encomenderů. Navrhli tedy posílit královskou autoritu, a proto byly vyhlášeny Nové zákony (1542) a byla vytvořena složitá správa. Úkolem evangelizace v oblasti Mixtecu a Zapotecu bylo dílo dominikánského řádu, který v podstatě původním dílem stavěl honosné kostely a kláštery v místech, kde byla soustředěna velká populační centra, jako je město Antequera, Yanhuitián a Cuilapan. .
Duchovní dobytí bylo radikálnější a násilnější než vojenské dobytí. Aby si dobyvatelé udrželi kontrolu nad obyvatelstvem, udržovali s úpravami určité domorodé stavby takovým způsobem, že se některým náčelníkům údolí Oaxaca a Mixteca Alta podařilo zachovat starodávná privilegia a vlastnosti; Místo toho, aby přeměnili národy Ameriky na křesťanství, snažili se misionáři zničit jakoukoli stopu náboženství předhispánského světa.
Přes demografický pokles původního obyvatelstva způsobený epidemiemi a špatným zacházením bylo 16. století hospodářským růstem díky zavedení nových technik, plodin a druhů. Například ve společnosti Mixteca byly dobré zisky získány z využívání bource morušového, skotu a pšenice. K tomuto růstu přispěl rozvoj městského trhu a dolů.
Tuto prosperitu však přerušily problémy, kterým těžba čelila od roku 1590. Obchod mezi Sevillou a Amerikou se snížil a pokles počtu obyvatel způsobil pokles spotřeby měst a počet zaměstnanců se snížil na minimální vyjádření.
V sedmnáctém století nastala hospodářská krize, kdy byly definovány koloniální struktury, konsolidován systém nadvlády a byly vytvořeny mechanismy závislé ekonomiky. Uplatnění monopolu a centralizovaného obchodního režimu brzdilo regionální hospodářský rozvoj, což způsobilo, že oblasti tak bohaté jako údolí Oaxaca zaměřily svou ekonomiku na soběstačnost navzdory důležitosti produkce a obchodu s kakaem, indigem a košenilou. .
Již ve druhé polovině sedmnáctého století se ekonomika Nového Španělska začala zlepšovat: těžařská výroba se vzpamatovala, obchod se Střední Amerikou a Peru byl znovu povolen a domorodé obyvatelstvo se začalo zotavovat. Do této doby se Španělé žijící v Mixtece a v údolí Oaxaca věnovali chovu dobytka ve velkých poměrech a haciendové úspěšně kombinovali produkci pšenice a kukuřice s chováním dobytka. Koloniální ekonomika byla restrukturalizována v letech 1660 až 1692 a položila základy osvícenského století.
Nové Španělsko roste a prosperuje ve věku osvícení. Území se zdvojnásobí, počet obyvatel se ztrojnásobí a hodnota ekonomické produkce šestkrát. Nejlepším příkladem těchto pokroků je těžba, ústřední ekonomická osa, která, i když stále zotročuje, přešla z práce 3 300 000 pesos v roce 1670 na 27 000 000 v roce 1804.
Bohatství Nového Španělska se projevuje v intenzivní stavební činnosti a přetéká ve velkoleposti baroka, tehdy se v Antequere kaple růžence kostela Santo Domingo, Soledad, San Agustín a Consolación.
18. století bylo stoletím modernizace politických a ekonomických reforem provedených Bourbonskými králi.
Do roku 1800 se Mexiko stalo zemí mimořádného bohatství, ale také extrémní chudoby, většina populace byla připoutána k haciendám a komunám, bylo s nimi špatně zacházeno na pracovištích, zotročováno v dolech a mlýnech, bez svobody, bez peněz. a bez jakékoli šance na zlepšení.
Poloostrovní Španělé monopolizovali politickou a ekonomickou moc; Takové podmínky sociální, ekonomické a politické nerovnosti nahromadily napětí a nespokojenost. Na druhé straně dopad událostí, jako je francouzská revoluce, nezávislost Spojených států a anglická průmyslová revoluce, otřásá americkým svědomím a myšlenka nezávislosti nového Španělska se začíná formovat v kreolech.
