Městská struktura tohoto města, postavená na svazích kopců, se musela přizpůsobit topografickým aspektům terénu, i když se snažila respektovat síťový tvar jako šachovnice.
Tento aspekt mu nakonec umožnil měřit a harmonicky růst, což si v průběhu staletí zachovalo svůj původní charakter. Jeho základ vznikl z potřeby chránit a chránit cestující, kteří se přepravovali mezi Zacatecasem a hlavním městem tehdejšího království Nového Španělska a přepravovali hlavně nerosty a byli obléháni domorodými nomády národa Chichimeca. Kolem roku 1542 se Fray Juan de San Miguel založil v blízkosti současného města město se jménem Itzcuinapan, zasvěcující archanděla San Miguela jako patrona. Tato primitivní populace měla kromě nepřetržitých a násilných útoků domorodých Chichimecas z okolních oblastí vážné problémy s dodávkou vody. Z tohoto důvodu obyvatelé Villa de San Miguel přesunuli osadu o několik kilometrů na severovýchod; To bylo místo, kde v roce 1555 založil Don Ángel de Villafañe na žádost místokrále Dona Luise de Velasca Villa de San Miguel el Grande. Místokrál také požadoval, aby se tam usadili španělští sousedé, kterým by byla poskytnuta půda a dobytek, zatímco domorodým obyvatelům, kteří v ní žili, by byla odpuštěna pocta a byli by ovládáni svými vlastními náčelníky, aby se vyhnuli dalším povstáním.
8. března 1826 jej státní kongres změnil na město a změnil svůj název, který by od nynějška měl být San Miguel de Allende, na počest slavného povstalce, který se tam narodil v roce 1779.
Uvnitř tohoto atraktivního koloniálního obrazu je umístěno několik skutečně pozoruhodných paláců té doby. Mezi nejvýznamnější patří Městský palác, dříve radnice postavená v roce 1736. Dům, kde se narodil Ignacio Allende, je příkladem barokní architektury města, zejména na jeho fasádě, a v současnosti je muzeem. Kanál Casa del Mayorazgo de la Canal s krásnou neoklasicistní fasádou dokončil koncem 18. století José Mariano de la Canal y Hervas, radní, děkan a královský prapor. Starý panský dům Dona Manuela T. de la Canal, stavba z roku 1735, která byla renovována podle projektu slavného španělského architekta Dona Manuela Tolsá z roku 1809; v budově v současné době sídlí Allende Institute a zdůrazňuje šíři jejích vnitřních nádvoří, nádhernou kapli a mimořádné oblouky. Dům inkvizitora, který sloužil jako sídlo komisaře Svatého úřadu a který pochází z roku 1780. Dům Marqués de Jaral de Berrio, postavený na konci 18. století, a dům hrabat z Loja s elegantní fasádou.
Pokud jde o náboženskou architekturu, město se může pochlubit také architektonickými poklady mimořádné hodnoty, jako je kostel a klášter Santo Domingo, střízlivá budova z roku 1737. Klášter Leal de la Concepción, který je v současné době Kulturním centrem, Je to pozoruhodná budova pro svou obrovskou terasu; Byl postaven v 18. století architektem Francisco Martínez Gudlño.
Kaple Santa Cruz del Chorro, jedna z nejstarších; chrám třetího řádu z počátku sedmnáctého století. Nádherný soubor chrámu a modlitebny San Felipe Neri z počátku 18. století; kostel má bujnou barokní fasádu v růžovém lomu s výzdobou silného domorodého vlivu. Jeho interiér má pestrou a bohatou výzdobu mezi nábytkem, sochami a obrazy hodnými obdivu, kromě nádherné kaple Santa Casa de Loreto a jejího Camarín de la Virgen, které jsou skvěle vyzdobené a které jsou způsobeny oddaností markýze Manuela Tomás de la Canal. V blízkosti oratoře je chrám Panny Marie Zdraví, postavený v 18. století se zapuštěnou fasádou korunovanou velkou skořápkou.
Mezi nejatraktivnější ve městě patří také sanfranciský chrám z 18. století s krásnou fasádou Churrigueresque a slavná farnost je téměř symbolem San Miguel de Allende; Ačkoli jeho novogotická stavba je novější, byla postavena na struktuře starého chrámu ze 17. století a plně respektovala jeho interiér a původní plán.
Velmi blízko města je svatyně Atotonilco, stavba střízlivých rozměrů ze 13. století, která vypadá jako pevnost a uvnitř které jsou zachovány cenné obrazy ze stejného století.
